Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT82Q9NSB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT82Q9NSB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT82Q9NSB4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT82Q9NSB4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms