Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3GQ9NS98 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3GQ9NS98 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3GQ9NS98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms