Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF3Q9NRP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAF3Q9NRP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms