Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITM2CQ9NQX7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITM2CQ9NQX7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITM2CQ9NQX7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITM2CQ9NQX7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITM2CQ9NQX7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms