Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HINT3Q9NQE9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HINT3Q9NQE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms