Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCM1Q9NP62 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCM1Q9NP62 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCM1Q9NP62 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCM1Q9NP62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms