Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C6orf50Q9HD87 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C6orf50Q9HD87 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
C6orf50Q9HD87 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
C6orf50Q9HD87 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms