Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD4Q9HCU8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD4Q9HCU8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD4Q9HCU8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD4Q9HCU8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms