Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LY9Q9HBG7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LY9Q9HBG7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LY9Q9HBG7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LY9Q9HBG7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms