Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE1Q9HBF4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFYVE1Q9HBF4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFYVE1Q9HBF4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms