Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP1Q9H902 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
REEP1Q9H902 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REEP1Q9H902 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REEP1Q9H902 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms