Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR55Q9H6Y2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR55Q9H6Y2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR55Q9H6Y2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms