Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIBC2Q9H4K1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIBC2Q9H4K1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIBC2Q9H4K1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIBC2Q9H4K1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms