Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R8

GABARAPL1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1Q9H0R8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL1Q9H0R8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPL1Q9H0R8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL1Q9H0R8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms