Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R5

GBP3, Guanylate-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP3Q9H0R5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP3Q9H0R5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP3Q9H0R5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP3Q9H0R5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP3Q9H0R5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP3Q9H0R5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms