Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GPR88Q9GZN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GPR88Q9GZN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPR88Q9GZN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPR88Q9GZN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPR88Q9GZN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPR88Q9GZN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPR88Q9GZN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPR88Q9GZN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPR88Q9GZN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPR88Q9GZN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms