Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM31Q9BZY9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM31Q9BZY9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM31Q9BZY9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms