Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN4RQ9BZR6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4RQ9BZR6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4RQ9BZR6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RQ9BZR6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms