Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
UPF3BQ9BZI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF3BQ9BZI7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
UPF3BQ9BZI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPF3BQ9BZI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UPF3BQ9BZI7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms