Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms