Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RNF17Q9BXT8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RNF17Q9BXT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RNF17Q9BXT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RNF17Q9BXT8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RNF17Q9BXT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms