Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIPINQ9BVW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIPINQ9BVW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TIPINQ9BVW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIPINQ9BVW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms