Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED9Q9BVK6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED9Q9BVK6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED9Q9BVK6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED9Q9BVK6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED9Q9BVK6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED9Q9BVK6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED9Q9BVK6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms