Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LIMD2Q9BT23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIMD2Q9BT23 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LIMD2Q9BT23 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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