Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF4Q9BSR8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YIPF4Q9BSR8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF4Q9BSR8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF4Q9BSR8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms