Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIPSNAP3BQ9BS92 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NIPSNAP3BQ9BS92 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms