Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERP44Q9BS26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERP44Q9BS26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP44Q9BS26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP44Q9BS26 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP44Q9BS26 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms