Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF559Q9BR84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF559Q9BR84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF559Q9BR84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms