Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM1Q9BR11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZSWIM1Q9BR11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms