Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPSNAP1Q9BPW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms