Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6BQ99941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF6BQ99941 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF6BQ99941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms