Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3AQ99856 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3AQ99856 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3AQ99856 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID3AQ99856 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3AQ99856 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms