Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIGMAR1Q99720 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIGMAR1Q99720 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms