Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX2Q99697 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX2Q99697 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX2Q99697 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms