Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
MEIS3Q99687 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MEIS3Q99687 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
MEIS3Q99687 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MEIS3Q99687 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MEIS3Q99687 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms