Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RGPD5Q99666 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RGPD5Q99666 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RGPD5Q99666 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD5Q99666 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD5Q99666 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RGPD5Q99666 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD5Q99666 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD5Q99666 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD5Q99666 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD5Q99666 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD5Q99666 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD5Q99666 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD5Q99666 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RGPD5Q99666 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD5Q99666 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD5Q99666 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD5Q99666 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD5Q99666 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD5Q99666 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD5Q99666 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD5Q99666 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD5Q99666 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD5Q99666 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RGPD5Q99666 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RGPD5Q99666 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD5Q99666 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms