Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC22D3Q99576 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSC22D3Q99576 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC22D3Q99576 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms