Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRBNQ96SW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRBNQ96SW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRBNQ96SW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CRBNQ96SW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRBNQ96SW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms