Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
IFT140Q96RY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
IFT140Q96RY7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC43■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC43■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC43■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
IFT140Q96RY7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
IFT140Q96RY7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
IFT140Q96RY7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
IFT140Q96RY7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.43
IFT140Q96RY7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
IFT140Q96RY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
IFT140Q96RY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
IFT140Q96RY7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
IFT140Q96RY7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms