Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERD3LQ96RJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FERD3LQ96RJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FERD3LQ96RJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FERD3LQ96RJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms