Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK1Q96QP1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK1Q96QP1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK1Q96QP1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK1Q96QP1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms