Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TEFMQ96QE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TEFMQ96QE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TEFMQ96QE5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms