Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4LQ96PU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4LQ96PU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD4LQ96PU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms