Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK2Q96PF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK2Q96PF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK2Q96PF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK2Q96PF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK2Q96PF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK2Q96PF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK2Q96PF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSSK2Q96PF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSSK2Q96PF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms