Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC46A1Q96NT5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC46A1Q96NT5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A1Q96NT5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A1Q96NT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms