Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP3Q96NJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZFP3Q96NJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms