Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSMCE3Q96MG7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMCE3Q96MG7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE3Q96MG7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms