Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16BQ96JE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC16BQ96JE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms