Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EAF1Q96JC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EAF1Q96JC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms