Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BORCS6Q96GS4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BORCS6Q96GS4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BORCS6Q96GS4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BORCS6Q96GS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms